Die Stadtbibliothek ist das Stammhaus der Bibliotheken Schaffhausen und als Magazinbibliothek organisiert, bei der man die Bücher bestellt und am Schalter abholt. Sie umfasst die älteren Bücher der Bibliothek. In ihrem Kulturgüterschutzraum lagert zudem der reiche historische Buchbestand. Ebenfalls in der Stadtbibliothek werden die Scaphusiana aufbewahrt (Literatur über Schaffhausen sowie von Schaffhauser Verlagen und Autor/innen). Insgesamt umfasst der Bestand der Stadtbibliothek am Münsterplatz ca. 230’000 Einheiten.